Sein Aufenthalt in Wien endete 1839, nachdem er in der Zeitschrift Adler liberale Artikel veröffentlicht hatte, mit seiner Ausweisung aus der Stadt.
Von 1848 an galt Sabina als eine der führenden Persönlichkeiten der tschechischen radikalen Demokraten, war Mitglied des Geheimbundes Repeal und der Schriftstellervereinigung Májovci. Sabina war ein begabter und beliebter Volksredner und für kurze Zeit Abgeordneter des böhmischen Landtages.
1849 wurde er wegen Teilnahme am Prager Pfingstaufstand verhaftet. Wegen Verhandlungen, die er und andere Patrioten mit dem in Prag weilenden russischen Anarchisten Michail Alexandrowitsch Bakunin geführt hatten, wurde er im März 1853 zunächst zum Tode, dann zu 18 Jahren Zuchthaus verurteilt. Im Mai 1857 begnadigt, kehrte Sabina vom Gefängnis in Olmütz nach Prag zurück und lebte wieder als Schriftsteller.